Deep Plant Phenomics—复杂植物表型任务深度学习平台

作者:谷丰光电 来源: 时间:2017-10-10 09:54:08 次数:

该软件已作为开源软件包发布,以促进植物表型爱好者的深入学习。

Deep Plant Phenomics—复杂植物表型任务深度学习平台

Example of filters in the first convolutional layer of a network being applied to the input image in stride convolutions.


一个名为Deep Plant Phenomics的开源深度学习工具。这个工具为几种常见的植物表现型任务提供了预先训练的神经网络,以及植物科学家可以使用的简单平台,为自己的表型应用训练模型。我们报告了三种植物表现基准的性能结果,包括叶片计数表现的最新进展,以及首次发布拟南芥突变分类和年龄回归任务的结果。


本文主要介绍了背景(植物表型图像分析、深入学习、卷积神经网络)、方法(软件和算法、数据集和测试、途径)及最后的到结果及最终的讨论。


Deep Plant Phenomics—复杂植物表型任务深度学习平台

Example training (red) and testing (blue) curves for several benchmarktasks. (A) Multi-strain Arabidopsis leaf counting. (B) Tobacco leaf counting. (C) Age regression. (D) Mutant classifier.


基于图像的植物表型深入学习平台,通过执行三个基于图像的表型分析来证明其有效性,实现了叶片计数的最新结果,并为突变分类和年龄回归设定了基线结果。该软件已作为开源软件包发布,以促进植物表型爱好者的深入学习。


来源:

Front. Plant Sci., 07 July 2017

Jordan R. Ubbens and Ian Stavness.Deep Plant Phenomics: A Deep Learning Platform for Complex Plant Phenotyping Tasks.https://doi.org/10.3389/fpls.2017.01190