LeafletAnalyzer--一款用于叶片的量化、比较和分类的自动化软件

作者:谷丰光电 来源: 时间:2017-09-28 10:08:43 次数:

文章报告了LeafletAnalyzer用于分析和分类含有三叶的苜蓿的叶片和锯齿特征。

LeafletAnalyzer--一款用于叶片的量化、比较和分类的自动化软件

用LeafletAnalyzer对叶片进行图像处理

在植物中我们发现了从简单到复合叶片的不同叶片形态。众所周知,叶片的最终大小和形状会随着发育和环境的改变而产生很大变化,然而,叶片的大小和形状变化只能在有限数量的物种中被定量的表现出来。本文报告了LeafletAnalyzer,一款用于自动图像分析和分类软件的开发,用于分析和分类了含有三叶的蒺藜苜蓿的叶片和锯齿特征。该软件以自动或手动的方式处理高质量的叶子图像,以生成叶片和锯齿的尺寸和形状参数。此外,它使用椭圆傅里叶变换生成每个叶片的光谱成分。


LeafletAnalyzer--一款用于叶片的量化、比较和分类的自动化软件

软件计算的叶片参数

重建研究表明,该光谱成分可以可靠的重建原始单张图像,分别对应小叶轮廓和锯齿的低、中、高频率光谱分量。该软件使用人工神经网络(ANN)和K均值(K-means)分类方法对基因型在茎上的连续节点或基因型(如自然变异和发育突变体)上的单叶组进行分类。该软件的自动化功能允许在短时间内对成千上万个叶样本进行分析,从而有助于根据叶片发育过程中的小叶尺寸、形状和锯齿特征以及诱导突变体和自然变异之间叶组的鉴定、比较和分类。


来源:

Front. Plant Sci., 31 May 2017

Fuqi Liao, Jianling Peng and Rujin Chen

LeafletAnalyzer, an Automated Software for Quantifying, Comparing and Classifying Blade and Serration Features of Compound Leaves during Development, and among Induced Mutants and Natural Variants in the Legume Medicago truncatula